หลักการทำงานของการฆ่าเชื้อในห้องปฏิบัติการส่วนใหญ่เกี่ยวข้องกับหลักการพื้นฐานของอุณหพลศาสตร์และจุลชีววิทยาและผลการฆ่าเชื้อนั้นทำได้โดยการควบคุมอุณหภูมิและเวลา โดยเฉพาะ:
การรักษาด้วยความร้อน: เครื่องฆ่าเชื้อฆ่าจุลินทรีย์โดยเฉพาะแบคทีเรียไวรัสและยีสต์โดยการให้ความร้อน อุณหภูมิสูงสามารถทำลายโครงสร้างเซลล์ของจุลินทรีย์ได้อย่างมีประสิทธิภาพทำให้พวกเขาสูญเสียกิจกรรมทางชีวภาพ
การควบคุมอุณหภูมิ: เครื่องฆ่าเชื้อสามารถควบคุมอุณหภูมิของรายการที่ประมวลผลได้อย่างแม่นยำ ในการแปรรูปอาหารมักจะมีการเลือกและบำรุงรักษาอุณหภูมิที่เฉพาะเจาะจงในช่วงเวลาหนึ่งเพื่อให้แน่ใจว่าผลการทำหมันที่มีประสิทธิภาพในขณะที่ลดผลกระทบต่อคุณภาพของผลิตภัณฑ์
สื่อการถ่ายเทความร้อน: สารฆ่าเชื้อมักใช้ไอน้ำหรือน้ำร้อนเป็นสื่อการถ่ายเทความร้อนซึ่งสามารถถ่ายโอนความร้อนไปยังผลิตภัณฑ์เพื่อให้ถึงอุณหภูมิที่จำเป็นสำหรับการฆ่าเชื้อ
การควบคุมความดัน: การฆ่าเชื้อมักจะปิดผนึกเพื่อป้องกันไม่ให้อากาศภายนอกเข้าและส่งผลกระทบต่อผลการฆ่าเชื้อ จุดเดือดของน้ำเพิ่มขึ้นโดยการเพิ่มความดันภายในซึ่งจะทำให้อุณหภูมิการทำหมันสูงขึ้น